兖州是全国八大铁路枢纽之一，京沪铁路纵贯南北，新石铁路横跨东西，兖州火车客站是一等客运站，每天停靠的旅客列车达98列，从兖州可直达国内几乎所有省会城市。货运站是一等区段站，是山东境内最大的铁路货运编组站，另外还有三处小型货运站，是鲁西南最大的货运集散地和客运中转站。公路四通八达，公路通车里程达到825公里，其中高速公路通车里程19.2公里。东临京福高速公路和104国道，日（照）东（明）高速公路穿境而过，出入口距市区仅 5公里；境内有327国道、汶邹公路等九条国家级、省级高等级公路干线穿过。